Conseguentemente al D.L.vo 502/92, modificato ed integrato dal D.L.vo 517/93, si è proceduto alla ristrutturazione del S.S.N. ed alla individuazione, fra l'altro, delle Aziende UU.SS.LL. e delle Aziende Ospedaliere.

Nella Regione Sicilia, con il recepimento delle direttive nazionali (L.R. n.39/95), l'Ospedale di Sciacca è stato così costituito in Azienda, dotato di personalità giuridica ed autonomia organizzativa, amministrativa, patrimoniale e contabile.

La Gestione dell'Azienda è stata affidata ad una sola persona, nominata dalla Regione, il Direttore Generale, che deve provvedervi, nel rigoroso rispetto dei principi di economicità ed efficienza, attraverso la predisposizione degli strumenti per un'effettiva programmazione della tutela della salute.

Il Direttore Generale, nell'esercizio delle sue funzioni, viene affiancato e coadiuvato dal Direttore Amministrativo e dal Direttore Sanitario, entrambi da lui nominati, nonché da un apposito staff, dall'Ufficio Statistica e dall'Ufficio Relazioni con il Pubblico, che nel processo di aziendalizzazione rivestono un ruolo di particolare importanza.

Allo stato risultano titolari delle suddette funzioni i Signori: 

L'Ufficio Statistica dell'Azienda, così come previsto dalle normative vigenti, provvede alla raccolta, all'elaborazione ed alla valutazione di informazioni e dati economici e sanitari, ed è inserito nel circuito informativo regionale e nazionale.

Un organismo previsto dalla legge di riordino, già attivato, è quello del Consiglio dei Sanitari, organo elettivo presieduto dal Direttore Sanitario e con compiti di consulenza per il Direttore Generale.

Il Direttore Amministrativo dirige il Settore AA.GG. e Personale e il settore Provveditorato-Economato-Tecnico-Economico-Finanziario (P.E.T.E.F.).